Genelkurmay Başkanlığı, İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından, 6 Aralık 2010 tarihinde Gölcük Donanma Komutanlığı'nda ortaya çıkarılan belgelerle ilgili açıklama yaptı. Açıklamada, belgeler çerçevesinde "herkesin suçluymuş" gibi gösterilmeye çalışıldığı ve masumiyet karinesinin ihlal edildiği bildirdi. Söz konusu açıklamada şöyle denildi: "TSK yargı sürecini sabır ve itidalle izlemektedir. Bu çerçevede TSK yargının doğruyu ortaya çıkarmasını beklemektedir."
