Başladığı günden beri zirveden inmeyen Kurtlar Vadisi Pusu, yeni sezonda da macerasına hızını kesmeden devam ediyor. Polat Alemdar, terörün arkasındaki istihbarat savaşlarını bir bir deşifre etmek için harekete geçiyor. Kurtlar Vadisi Pusu, Polat'ın ailesini kaybettikten sonra yüzünü değiştirmeye karar vermesiyle başlıyor. İsrail gizli servisinden bir tim, Hatay'da 4 polisi şehit eder. Tim yakalanır ancak bu saldırıyı terör örgütü kisvesi altında yaptıklarını söylerler. İstihbarat, timi kaçırır. Polat, timin İncirlik'te olduğunu öğrendikten sonra, son bir bu timi ele geçirmek ve İncirlik'te dönen nükleer silah pazarlığını bozmak için harekete geçer…