Monaco'da gerçekleştirilen kura çekimine UEFA Şampiyonlar Ligi'nde play-off turunda elenen 10 takımla birlikte toplam 48 ekip katıldı. Temsilcilerimizden Trabzonspor'un Avrupa Ligi'ndeki rakipleri de bu kura çekiminde belli oldu. J Grubu'nda yer alan bordo mavililerin rakipleri İtalya'dan Lazio, Polonya'dan Legia Varşova ve Kıbrıs Rum Kesimi'nden Apollon Limassol oldu.
Ligde grup maçları 19 Eylül'de başlayacak ve 12 Aralık'ta sona erecek. Son 32 turu maçları 20 ve 27 Şubat 2014, son 16 turu karşılaşmaları 13 ve 20 Mart 2014, çeyrek finaller 3 ve 10 Nisan 2014, yarı finaller ise 24 Nisan ve 1 Mayıs 2014'te yapılacak. UEFA Avrupa Ligi'nde final maçı 14 Mayıs 2014'te İtalya'nın Torino kentindeki Juventus Arena'da oynanacak.
Grimaldi Forum'daki kura çekiminde 48 takım, 4'erli 12 gruba ayrıldı. İşte gruplar:
A GRUBU: Valencia, Swansea City, Kuban Krasnodar, St Gallen
B GRUBU: PSV Eindhoven, Dinamo Zagreb, Chornomorets Odesa, Ludogorets
C GRUBU: Standard Liege, Salzburg, Elfsborg, Esbjerg
D GRUBU: Rubin Kazan, Wigan, Maribor, Zulte Waregem
E GRUBU: Fiorentina, Dnipro, Paços de Ferreira, Pandurii
F GRUBU: Bordeaux, APOEL, E.Frankfurt
G GRUBU: Dinamo Kiev, Genk, Rapid Wien, Thun
H GRUBU: Sevilla, Freiburg, Estoril, Slovan Liberec
I GRUBU: Lyon, Real Betis, Vitoria Guimares, Rijeka