1972 yılında İstanbul'da dünyaya gelen ve aslen Siirtli olan Hakan Altun, lisans eğitimini İstanbul Teknik Üniversitesi Türk Musikisi Devlet Konservatuarı'nda tamamladı.
Yüksek lisansını da İstanbul Teknik Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü'nde yapan Altun, 1994 yılında Edirne Türk Devlet Müziği topluluğunda çalıştı. Ancak ünlü şarkıcı 1997'de vatani görevini yapmak için askere gitti ve topluluktan ayrıldı.
Askerliğini yaptığı Ankara'da besteci yönünü keşfeden Hakan Altun, 1998 yılında kendi adını taşıyan ilk albümünü çıkardı. Sevilen sanatçı ilk albümündeki "Hani Bekleyecektin" adlı şarkısı ile o dönem büyük bir çıkış yakaladı.
2000 yılında "Ağlamak Yok Yüreğim" adlı ikinci albümünü çıkaran Altun'un, albümde yer alan "Her Sevda Bir Ölümmüş" adlı şarkısına Şebnem Schaefer ile çektiği video klibi ile ses getirdi
Kariyeri kadar özel hayatıyla da gündem olan Altun, Ebru Gündeş, Seray Sever, İclal Aydın ve Gonca Vuslateri gibi ünlü isimlerle aşk yaşadı.