Hamdi Alkan, 1989 yılında meslektaşı Canan Hoşgör ile dünyaevine girdi ve 1998'te kızı Zeynep Alkan'ı kucağına alarak ilk kez babalık heyecanını yaşadı. Çift 1999'da boşandı ancak 2006 yılında tekrar evlendi. Ünlü çiftin 2007 senesinde de Ayşe adını verdikleri bir kızları daha oldu. Mart 2012 yılında ise Hamdi Alkan ile Canan Hoşgör bir kez daha yollarını ayırdı.
Hamdi Alkan 24 Nisan 2014 tarihinde ise Selen Görgüzel ile Roma'da evlendi. Ancak çiftin evliliği 2022'de son buldu.
Boşanma sonrası eski eşi Selen Görgüzel'le uzun bir süre gündem olan Alkan, bu kez yeni aşkıyla çok konuşuldu.
Sabah'tan Bülent Cankurt, konuyla ilgili şu yazıyı kaleme aldı: "58 yaşındaki ünlü yönetmen ve oyuncu Hamdi Alkan, dördüncü kez damat olmaya hazırlanıyor! Evet, yanlış okumadınız. Ancak bu kez daha önceki evlilikleri gibi kendi sektöründen biriyle değil bambaşka bir meslekten bir kadınla hayatını birleştirecek.
Kızlarının annesi oyuncu Canan Hoşgör ile iki kez evlenip 2012'de ikinci kez boşanan Hamdi Alkan, ikinci evliliğini 2014'te oyuncu ve şarkıcı Selen Görgüzel ile yapmış, bu evliliği de 2022'de bitmişti.
