Bursaspor ve Trabzonspor'un elenmesinin ardından ülkemizi bu kupada sadece Fenerbahçe temsil edecek.
Avrupa Ligi'nde 4'erli 12 grup oluşurken, gruplarında ilk iki sırayı alan takımlar bir üst tura çıkacak. 20 Eylül'de başlayacak grup maçları 6 Aralık'ta son bulacak ve takımlar toplam 6 maç yapacak.
Final 15 Mayıs 2013'te Amsterdam'da oynanacak.
Kuraya 2. torbadan girecek olan Fenetbahçe'nin 1., 3. ve 4. torbalardaki muhtemel rakipleri ise şunlar:
1. torba: Atletico Madrid, Inter, Liverpool, Lyon, Marsilya, Sporting, PSV, Tottenham, Bayer Leverkusen, Bordeaux, Twente, Stuttgart
2. torba: Fenerbahçe, Basel, M. Kharkiv, Panathinaikos, Athletic Bilbao, Kopenhag, Rubin Kazan, Napoli, Udinese, Brugge, Hapoel Tel-Aviv, Hannover
3. torba: Lazio, Steaua Bükreş, Sparta Prag, Rosenborg, Newcastle, Young Boys, Levante, Genk, M'gladbach, Partizan, Viktoria Plzen, Dnipro
4. torba: Helsingborg, Maritimo, Rapid Wien, Academica, Anzhi, Maribor, AIK Stockholm, Limassol, Hapoel Kiryat, Molde, Videoton, Neftçi Bakü