"Balyoz" seminer sonuç raporunun, Kara Kuvvetleri Komutanlığı karargahında olduğu ancak "devlet sırrı" gerekçesiyle savcılara gönderilmediği ortaya çıktı. "Balyoz" soruşturması başladığında savcılar, 1. Ordu Komutanlığı, Kara Kuvvetleri Komutanlığı ve Genelkurmay Başkanlığı'na başvurarak 2003 tarihli seminere ilişkin bilgi ve belge istedi. 1. Ordu ve Genelkurmay ellerinde belge bulunmadığını bildirdi. Kara Kuvvetleri ise 19 Nisan 2010'da yanıt verdi. Adli Müşaviri Hakim Albay Ahmet Vurucu, sonuç raporunun komutanlığın "kozmik odası"nda bulunduğunu bildirdi. Ancak rapor "devlet sırrı" niteliği taşıdığı gerekçesiyle savcılara gönderilmedi.