Atakan Aksoy, 1974 yılında Trabzon'da doğdu. İlk ve orta okulu Yomra ilçesinde liseyi ise Trabzon'da okuyan Aksoy, 1990 yılında Karadeniz Teknik Üniversitesi (KTÜ) İnşaat Mühendisliği Bölümünü kazandı. KTÜ'de 1994 yılında lisans, 1997 yılında yüksek lisans ve 2001 yıllarında da doktora eğitimlerini tamamladı. Akademik olarak çeşitli görevlerde bulunan Aksoy, evli ve iki çocuk babasıdır.