Mustafa Aydın, 1 Mart 1968 yılında Çorum'un Dodurga ilçesinde doğdu. Ankara Üniversitesi Sosyal Bilimler Bölümü ve Anadolu Üniversitesi İktisat Fakültesi'nde lisans eğitimlerini tamamlayan Aydın, 1991 yılında 19 Mayıs Polis Okulu'ndan mezun oldu. 2004 yılındaki yerel seçimlerde AK Parti'den Dodurga Belediye Başkanı olarak seçilen Aydın, görev süresinin tamamlanamsının ardından polis memurluğa tekrar döndü. 2014 yılında Demokrat Parti'den Belediye Başkanı seçilen Aydın, bir süre sonra partisinden istifa ederek, AK Parti'ye katıldı. Aydın, evli ve 2 çocuk babasıdır.